南通市妇幼保健院始建于1982年底，1983年4月1日正式开诊，前身为南通市妇产科医院。1985年，医院开设了综合门诊，1986年以后，随着医疗任务、床位和人员编制的增加，医院逐步走上了健康发展的道路。1988年，医院又开设了综合病房，走上了“大专科，小综合”的道路。